Não precisa mexer na configuração do emulador. Deixe-a padrão.
Como jogos de arcade têm resolução de tela variável, eu recomendo fixar o tamanho da tela em 1440x1080, se FHD, ou 2880x2160, se 4K. Para jogos verticais, 960x1080 e 1920x2160, respectivamente.
Acesse a opção de vídeo do RetroArch, Scaling e faça as seguintes alterações:
Horizontal
Integer Scale: OFF
Aspect Ratio: Custom
Custom Aspect Ratio X Pos.: 480 (4K) / 240 (FHD)
Custom Aspect Ratio Y Pos.: 0
Custom Aspect Ratio Width: 2880 (4K) / 1440 (FHD)
Custom Aspect Ratio Height: 2160 (4K) / 1080 (FHD)
Vertical
Integer Scale: OFF
Aspect Ratio: Custom
Custom Aspect Ratio X Pos.: 960 (4K) / 480 (FHD)
Custom Aspect Ratio Y Pos.: 0
Custom Aspect Ratio Width: 1920 (4K) / 960 (FHD)
Custom Aspect Ratio Height: 2160 (4K) / 1080 (FHD)
Para salvar, Main Menu > Quick Menu > Overrides.
Se for só para jogos de Neo Geo, por terem resolução de 304x224, você pode usar esta configuração:
Integer Scale: OFF
Aspect Ratio: Custom
Custom Aspect Ratio X Pos.: 320 (4K) / 160 (FHD)
Custom Aspect Ratio Y Pos.: -40 (4K) / -20 (FHD)
Custom Aspect Ratio Width: 3200 (4K) / 1600 (FHD)
Custom Aspect Ratio Height: 2240 (4K) / 1120 (FHD)